Είναι τακτικός καθηγητής, κάτοχος της έδρας Διεθνούς Τραπεζικού Δικαίου και Χρηματοοικονομικών στο Πανεπιστήμιο του Εδιμβούργου, επικεφαλής του Τομέα Εμπορικού Δικαίου, και διευθυντής του μεταπτυχιακού προγράμματος (LLM) με ειδίκευση στο Διεθνές Τραπεζικό Δίκαιο και τα Χρηματοοικονομικά.
Είναι επίσης μέλος του συμβουλίου της Ευρωπαϊκής Τραπεζικής Αρχής (ΕΤΑ), εκλεγμένος ως 'κορυφαίος ακαδημαϊκός', σύμφωνα με την οικεία κατηγοριοποίηση της ΕΤΑ.
O Αιμίλιος κατέχει επίσης θέση διακεκριμένου ερευνητή τακτικού καθηγητή στο Παν/μιο του Χονγκ Κόνγκ και έχει διατελέσει επισκέπτης καθηγητής ή διακεκριμένος ερευνητής σε πληθώρα διεθνών πανεπιστημίων συμπεριλαμβανομένων των νομικών σχολών του Harvard και του Yale.
Ο Αιμίλιος Αυγουλέας έχει πλήθος δημοσιεύσεων στο ευρύτερο πεδίο του Διεθνούς Οικονομικής Διακυβέρνησης, Διεθνούς και Ευρωπαϊκού Χρηματοοικονομικού Δικαίου, των Οικονομικών και της Συμπεριφορικής Χρηματοοικονομικής [behavioural finance].
Είναι ο συγγραφέας των βιβλίων Διακυβέρνηση των παγκόσμιων χρηματοοικονομικών αγορών: Δίκαιο, οικονομικά και πολιτική [Governance of Global Financial Markets: The Law, the Economics, the Politics (Cambridge University Press, 2012)] και Η μηχανική και η ρύθμιση της κατάχρησης της αγοράς: Μια νομική και οικονομική ανάλυση [The Mechanics and Regulation of Market Abuse: A Legal and Economic Analysis (Oxford University Press, 2005)].
Μαζί με τον καθηγητή Sir Ross Cranston υπογράφουν την έκδοση Αρχές του Τραπεζικού Δικαίου [Oxford Principles of Banking Law (Oxford University Press , 2018)], ενώ έχει συνεπιμεληθεί και συγγράψει τα βιβλία Αναθεωρώντας τα παγκόσμια χρηματοοικονομικά και τη ρύθμισή τους [Reconceptualising Global Finance and its Regulation (Cambridge University Press, 2016)] και Ένωση Κεφαλαιαγορών στην Ευρώπη [Capital Markets Union in Europe (Oxford University Press, 2018)].
Προετοιμάζει δε προς έκδοση το βιβλίο Η Πολιτική Οικονομία της Ρύθμισης των Χρηματοοικονομικών Αγορών [The Political Economy of Financial Regulation (Cambridge University Press, 2018/9)].
Το έργο του αναφέρεται συχνά σε μελέτες χάραξης πολιτικής στην Ελλάδα, στην Ευρωπαϊκή Ένωση, και διεθνώς και οι κοινές του δημοσιεύσεις με τον Chalres Godhart (LSE) μεταξύ 2014-2017 έχουν επηρεάσει καταλυτικά την πολιτική πολλών χωρών και της ΕΕ στα θέματα της εποπτείας και αναδιάρθρωσης τραπεζών.
O Αιμίλιος έχει σπουδάσει δίκαιο και οικονομικά στο London School of Economics.
Πριν επιστρέψει σον ακαδημαικό χώρο στα μέσα του 2007 εργάσθηκε σε κορυφάιες νομικές εταιρίες του City του Λονδίνου, όπως η Clifford Chance και η Linklaters. Αυτήν την εποχή διατελεί παράλληλα με τα ακαδημαϊκά του καθήκοντα σύμβουλος μεγάλων οργανισμών που δραστηριοποιούνται στο χώρο της τεχνολογίας blockchain και συμμετέχει ως ανεξάρτητο μέλος στην εξελεγκτική επιτροπή του ΤΧΣ επιλεγμένος από το Euro-working group.